定制虚拟库服务
针对靶标结构,为您定制专属虚拟化合物库
交付时间:2 - 4 周
针对靶标口袋,输出专属虚拟库
包含分子结构、构象结合 PDB 文件、虚拟库报告、并根据客户需求提供分子合成路径或配套实体分子采购服务
GPR52 虚拟库案例
相关背景
GPR52 是一个典型的 GPCR 孤儿受体,主要在大脑中表达并发挥重要的生理作用,被认为是治疗各种精神疾病,包括亨廷顿病、精神分裂症、认知障碍、脑畸形和多动症的潜在靶点。
靶标简介
GPR52 是 G 蛋白偶联受体(GPCR)家族的成员。该蛋白家族的成员包含七个假定的跨膜结构域,并可能通过激活异三聚体 G 蛋白介导细胞内部的信号传导过程。GPR52 基因定位于染色体 1q24,与 GPR21 具有最高的同源性(71%)。
研究进展
该靶标于 2020 年完成晶体结构解析,还未有临床报道,处于早期研发阶段。
关键位点和相互作用(以下位点为文献调研结果)
关键位点和相互作用(位点为文献调研结果)
Hydrogen bonds:
Cys40
Asp188
Ile189
Glu191
Hydrophobic:
Tyr34
Val39
Ile47
Leu101
Phe117
Thr303
π–π interactions:
Phe300
示例下载
线上仅开放下载200个示例分子
下载获取完整虚拟库与具体的合成路径请
联系我们示例展示
为了方面您对虚拟分子有更详细的认知,此处简单展示三个虚拟分子情况。(图片来源为 MolProphet™ 平台真实截图)
关键位点和相互作用(红色代表命中):
Hydrogen bonds:
Cys40
Asp188
Ile189
Glu191
Hydrophobic:
Tyr34
Val39
Ile47
Leu101
Phe117
Thr303
π–π interactions:
Phe300
关键位点和相互作用(红色代表命中):
Hydrogen bonds:
Cys40
Asp188
Ile189
Glu191
Hydrophobic:
Tyr34
Val39
Ile47
Leu101
Phe117
Thr303
π–π interactions:
Phe300
关键位点和相互作用(红色代表命中):
Hydrogen bonds:
Cys40
Asp188
Ile189
Glu191
Hydrophobic:
Tyr34
Val39
Ile47
Leu101
Phe117
Thr303
π–π interactions:
Phe300
质量评估
为了评估虚拟库质量与价值,我们综合统计了已知分子与虚拟库的各类属性情况。整体来看,相较已知活性分子,虚拟分子各项属性更加优异,且均在合理的成药区间内。具体统计结果如下:
Affinity
活性参数(结合自由能)
越大代表活性越好
对比结果
虚拟分子相对具有更高的理论活性
相对具有更高的理论活性
QED
成药性参数
越大代表成药性越好
对比结果
虚拟分子相对具有更加良好的成药性
相对具有更加良好的成药性
SA
合成性参数
越小代表合成性性越好
对比结果
虚拟分子合成难度相对更低
合成难度相对更低
MW
分子量
对比结果
虚拟分子相对具有更高的配体效率与更高的优化空间
相对具有更高的配体效率与更高的优化空间
LogP
油水分配系数
对比结果
虚拟分子相对具有更好的亲水性
相对具有更好的亲水性
TPSA
拓扑极性表面积
对比结果
虚拟分子与已知活性分子基本保持一致
与已知活性分子基本保持一致
HBA
氢键受体
对比结果
虚拟分子与已知活性分子基本保持一致,处于合理区间
已知活性分子基本保持一致,处于合理区间
HBD
氢键供体
对比结果
虚拟分子与已知活性分子基本保持一致,处于合理区间
已知活性分子基本保持一致,处于合理区间
nARS
总环数
对比结果
虚拟分子平均环数在 3 - 4 之间,处于合理区间
平均环数在 3 - 4 之间,处于合理区间